天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒
211216-100 天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒,產品簡介:產品品牌:天凈沙產品名稱:可調式易錯 PCR 試劑盒產品貨號:211216-100產品規格:100次
天凈沙211216-100可調式易錯 PCR 試劑盒
北京天凈沙基因科技有限公司,是一家聚焦科研試劑、動物檢驗檢疫、分子診斷的研發和生產企業。
211216-100 天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒,產品簡介:
產品品牌:天凈沙
產品名稱:可調式易錯 PCR 試劑盒
產品貨號:211216-100
產品規格:100次
211216-100 天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒
產品及特點
易錯PCR(Error-prone PCR)是利用Taq DNA多聚酶不具有3′→5′校對功能的特性,在一定條件下(如不同的dNTP濃度、Mg濃度和MnCl2存在)能夠按較高的機率引入隨機引入突變。如果有適當的選擇方法,則可從構建的突變庫選出所需突變體。本產品是在本公司的易錯PCR試劑盒的基礎上改進而得,本
產品具有下列特點:
1. 即開即用,十分簡單方便,尤其在生物制藥和酶學研究領域顯示出了它的*性。
2. 配方經過精心優化,實驗人員在一定范圍內可以控制突變率,一輪PCR的突變率范圍在2-8突變/1000bp,更高的突變率可以通過多輪PCR達到。
3. 可用于連續易錯PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易錯PCR的產物用作下一次易錯PCR的模板即可,使每一次獲得的小突變累積而產生重要的有益突變。
4. 可以擴增的DNA片段更長,達到2kb,對于2kb以上的產物,建議分段擴增。
5. 本試劑盒足夠100次30uL體系的易錯PCR。
6. 本產品只能用于科研。
規格及成分
本產品采用五孔盒包裝
成份 | 編號 | 規格 | 包裝材料 |
可調易錯PCR專用 Taq DNA聚合酶(5U/uL) | 101005c | 50 uL | 0.5mL紅蓋管 |
5×可調易錯PCR Mix(含dNTP | 211216a | 600 uL | 0.5mL黃蓋管 |
可調易錯PCR專用MnCl2 | 211216c | 300 uL | 0.5mL紫蓋管 |
可調易錯PCR專用dGTP | 211216d | 300 uL | 0.5mL藍蓋管 |
10×可調易錯PCR追加dNTP | 211216e | 300 uL | 0.5mL本色管 |
使用手冊 | 211216sc | 1份 | 無 |
運輸及保存
低溫運輸,-20℃保存, 有效期為一年
自備試劑
引物、DNA模板、常規PCR試劑盒
使用方法
1. 將引物稀釋到10uM。引物也是決定易錯PCR成敗的關鍵因素,設計引物時要保證其Tm在70℃,長度在25-30nt之間,GC含量在45%-60%之間,3端GC含量低,并且沒有發夾結構。
2. 用自備易錯PCR引物和自備的常規PCR試劑擴增制備易錯DNA模板(常規PCR產物),膠回收并準確確定濃度。注意:易錯PCR的模板一定要用膠回收的常規PCR產物,因為膠回收會可以把電泳不可見的非特異性擴增片段去除,否則這些片段由于也是用易錯PCR引物擴增所得,在易錯PCR擴增時也會被擴增,產生競爭抑制,降低靶分子的擴增效率。
3. 將回收的DNA片段(模板)稀釋到1ng/uL 、10ng/uL和100ng/uL三個濃度。注意:模板使用量是影響突變率的最重要因素,模板DNA為非突變DNA,擴增產生的DNA為突變DNA,易錯PCR體系最終DNA量是基本固定的,因此模板DNA使用量越大,則突變DNA在終產物中的相對比例就越低,突變率就越低。故建議同時測試三個模板用量。如果都成功,則優先選用模板濃度低的PCR產物進行分析。
4. 根據每1000bp的預期突變數按下表確定30uL易錯PCR體系中MnCl2和dGTP的用量(這是在模板DNA不超過1ng的前提下的數據)。表中的Mn表示可調易錯PCR專用的MnCl2, dG表示可調易錯PCR專用的dGTP:
預期突變數 | 2個 | 3個 | 4個 | 5個 | 6個 | 7個 | 8個 |
Mn用量(uL) | 0 | 1.0 | 2.5 | 4.0 | 4.0 | 4.0 | 4.0 |
dG用量(uL) | 0 | 0 | 0 | 1.0 | 2.0 | 3.0 | 4.0 |
5. 設置30uL體系的可調易錯PCR:第一次建議設置3個模板濃度。在3干凈的PCR管中,分別加入下列成分。最后加可調易錯PCR專用MnCl2
成分 | 模板用量1 | 模板用量2 | 模板用量3 |
可調易錯PCR Mix, 5× | 6 uL | 6 uL | 6 uL |
可調易錯PCR 專用dGTP | 根據上步用量表表選擇 | 根據上步用量表表選擇 | 根據上步用量表表選擇 |
自備DNA模板 | 1 uL (1ng/uL) | 1 uL (1ng/uL) | 1 uL (1ng/uL) |
自備PCR引物 (10 uM each) | 1 uL each | 1 uL each | 1 uL each |
可調易錯PCR專用 Taq DNA聚合酶 | 0.5 uL | 0.5 uL | 0.5 uL |
可調易錯PCR 專用MnCl2 | 根據上步用量表表選擇 | 根據上步用量表表選擇 | 根據上步用量表表選擇 |
自備超純水 | 補水到30uL | 補水到30uL | 補水到30uL |
6. 按已經優化的常規PCR條件進行易錯PCR:
PCR前變性 | 94℃ 3分鐘 |
易錯PCR(循環30-60次 | 94℃ 1分鐘 |
60℃ 1分鐘 | |
72℃ 3-10分鐘 |
注:由于易錯PCR含高濃度的鎂離子,因此容易形成引物二聚體,因此需要使用較高的復性溫度,以避免小片段擴增產物競爭性抑制PCR。易錯PCR一般不需要熱啟動,也不需要在易錯PCR結束后做延伸處理。易錯PCR循環次數越多,突變DNA(擴增產物)與非突變DNA(原始模板)的比例就越高。此外在突變率和模板長度恒定的情況下,擴增次數越多,發生突變的絕對數就越高,在同一模板上發生的突變位點數就越多,所以如果需要,可以做30、35、40、45、50、55、60次7個循環數的比較
7. 易錯PCR結束后,取3uL進行電泳檢查。
8. 如果有預期大小的PCR產物,則全部電泳,進行膠回收,再進行克隆和測序等后續操作。如果需要增加突變率,可以選擇一個突變后的DNA為模板,再進行下一輪易錯PCR。
9. 如果沒有預期大小的PCR產物,可以按下列操作追加進行一輪常規PCR(追加PCR)。
10. 在PCR管中,加入3uL 10×可調易錯PCR專用追加dNTP到27uL電泳剩下的PCR體系中,按下表進行追加PCR(chasing PCR)。注意追加PCR只做20次循環。
步驟 | 參數 | 循環數 |
追加PCR | 94℃ 1分鐘 | 循環20次 |
60℃ 1分鐘 | ||
72℃ 1分鐘 |
11. 追加PCR結束后,再電泳檢測。如果有條帶,再進行克隆和測序等后續操作。如果需要增加突變率,可以選擇一個突變后的DNA為模板,再進行下一輪易錯PCR。
12. 如果沒有預期大小的PCR產物,則需要分析原因
疑難解答
Q:現象:沒有PCR產物。
A:可能原因:一是引物沒有優化,可以重新設計引物;二是模板DNA太少,可以增加用量;三是模板不純,最好先膠回收;四是DNA溶液中有EDTA,可以適當補加Mg++。
Q:現象:太多的PCR條帶或PCR條帶模糊一片。
A:可能原因:一是模板有膠回收、二是PCR循環數太多;三是復性溫度太低;四是引物沒有優化;五是PCR條件沒優化,可以使用touch-down PCR。
Q: 如果需要更高的突變率,如何辦?
A: 可以使用連續多次易錯PCR來提高突變率。但最好先用膠純化回收易錯PCR片段,再用于下一輪易錯PCR。
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